肝脏虽然是免疫豁免器官，但是移植后肝脏还是有可能会出现排斥反应。肝移植排斥反应也是以细胞介导为主，抗体介导为辅，在临床上分为超急性排斥反应、急性排斥反应和慢性排斥反应，其中以急性排斥反应最为多见。超急性排斥反应多发生在移植术后24小时之内，临床非常罕见，主要表现为坏死性血管炎，移植肝脏功能丧失，这主要是由于受者体内存在着抗HLA抗体，因此术前的筛选是非常重要的。急性排斥反应主要发生在移植术后的一周或者数月内，大多数的可以通过增加免疫抑制剂的剂量得到很好的缓解。慢性排斥反应主要发生在移植术后的数月以及数年内，主要表现为移植的肝脏功能逐渐丧失，有可能需要再次行移植手术。