患者如果肝脏有小囊肿，建议患者及时复查，观察囊肿直径大小的变化，但是此类疾病的前提就是患者已经排除了肝脏的其他疾病，如肝脓肿以及肝包虫等疾病，排除此类疾病之后，患者应定期观察，每半年或者一年复查上腹部彩超，看囊肿直径大小的变化。如果囊肿直径小于5cm，一般不做处理；如果囊肿直径超过5cm，患者可以选择两种治疗方式：
一种是腹腔镜下肝囊肿去顶引流术，适用于肝脏囊肿位于肝脏表面，在腹腔镜直视下，将囊肿壁取出一部分，并且放置腹腔引流管，经过术后一周左右的引流，患者肝囊肿多可痊愈。
另外一种方法是经皮经肝超声引导下肝囊肿穿刺引流术，一般引流1-3天左右，待囊液流完，可以经导管注入无水酒精毁损囊壁，经过此类治疗，患者也多可痊愈。