类风湿性关节炎其并发症主要是会出现肺部的病变，表现为肺间质病变，可以导致患者出现活动或者劳累后出现干咳、气喘、呼吸困难、胸闷等症状，并且会进行性加重导致低氧血症。
晚期则会出现肺间质纤维化，或者胸腔积液，还可以出现皮肤或者内脏的类风湿结节。心脏也会出现并发症，主要出现心包炎，但一般并不很严重。
肾脏也会出现一些并发症，比如出现肾小球肾炎，偶尔也会导致淀粉样变性。神经系统损害可表现为多发性周围神经病变，或者腕管综合征等。此外血液系统的并发症，可以出现白细胞或者血小板的减少以及贫血的症状。