反应性关节炎最常见的病因是细菌感染，例如肺炎链球菌感染引起的肺炎，或肢体开放性外伤以后，局部造成的金黄色葡萄球菌感染。原发病灶感染一段时间后，会出现远处关节感染，常累及髋关节、膝关节等大关节。梅毒感染也可以引起反应性关节炎。非细菌性感染引起的反应性关节炎主要见于自身免疫性疾病，例如强直性脊柱炎、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等，治疗以后产生的反应性关节炎。还有一些病因目前尚未明确，考虑与自身免疫性疾病合并肿瘤性疾病有关，例如干燥综合征合并肺癌，治疗后出现的反应性关节炎。