脑脊膜膨出首选的治疗方法是手术，而手术的目的是消除膨出的肿块，而不能纠正畸形。所以对没有合并脑和脊髓畸形或者神经功能受损的脑脊膜膨出的类型，只要早期手术，术后没有明显的并发症，效果比较好，可以说能够达到治愈的标准。而对于其他的膨出形式，像脑膨出、脑膜脑膨出或者脑囊状膨出等类型以及脊髓脊膜膨出、脊髓膨出等，患儿出生的时候往往伴有严重的并发症，如肢体的完全瘫痪、不能控制的大小便等，即使手术以后症状也很难恢复正常，并且术后常常伴有明显的并发症。预后最差的是脑膜脑囊状膨出以及脊髓膨出，所以在产前检查如果发现胎儿有此种畸形，要决定是否终止妊娠。