骶骨脊索瘤临床查体可见骶部饱满，肛门触诊可触及肿瘤呈圆形、光滑、有一定的饱满度。肛门触诊是早期发现骶骨脊索瘤的常规检查，尤其是久治不愈的下腹部疼痛的患者，怀疑骶骨肿瘤时，肛门触诊是尤为重要的检查。缓慢生长的肿瘤包块多数向前方膨胀生长，临床不易发现，晚期时，当肿瘤向后破入臀肌、骶棘肌或皮下才被发现，下腹部也可触及肿块。