脊索瘤的治疗主要是通过手术治疗为主，但是手术的难度较大，同时由于脊索瘤对放射线不敏感，所以常规的放疗通常只能是姑息治疗作用，因此也可以通过放射外科治疗，比如像伽玛刀，质子刀X刀等，还可以通过其他的理疗热疗达到一定的治疗目的，同样的现在药物治疗也被关注，有文献报道药物靶向治疗可以减少脊索瘤的生长，从而延长患者的生存时间。