肛周脓肿在手术后一般两周左右伤口可以恢复。对肛周脓肿的手术，通常将脓肿切开脓液排出来，如果比较表浅，单纯做切开排脓即可，如果肛周脓肿比较深，有潜在内口出现，可能还需要做脓肿挂线手术，在手术治疗后可以有效的预防脓肿复发，也能够预防肛瘘出现。
在手术结束后伤口敞开，也就是不缝合，在伤口内部要填塞些纱条，能够起到引流的作用，也能够有效刺激伤口内部的肉芽组织生长，促进伤口愈合，所以伤口愈合的时间比较慢。肛周局部依然会有些炎症性病灶存在，后期需要继续抗感染治疗，对伤口进行换药等，有些患者建议高锰酸钾溶液坐浴，一般在一周左右伤口会逐渐缩小、逐渐愈合，大部分的患者在两周左右伤口能够长好。