肠结核患者可以通过以下诊断方式进行确诊：
1、粪便培养检测，肠结核常发生于盲肠、结肠等下消化道组织，所以此类病症患者其产生的粪便当中含有大量病原体。通过对粪便进行浓缩、分离、检测等方式，有助于对此类病症患者进行明确诊断。
2、超声影像检查，肠道组织感染结核分支杆菌后，会导致肠道淋巴组织出现充血性结节现象。通过超声影像检查方式，可以观察肠道局部出现肠腔变窄、边缘不整、组织增厚等情况。
3、肠镜检查，通过肠道内窥镜检查，不仅可以对结肠、盲肠、回肠等部位进行直观性观察，并且可以通过活体取样检测的方式，对患者病症类型进行明确性诊断。
此外，还可以查血中结核抗体，以及结核菌素试验等检查协助诊断。