如果是非梗阻性肥厚型心肌病，症状不明显，可以不治疗，密切观察既可。肥厚型梗阻性心肌病的患者，生活上应注意避免过劳，防止过度精神紧张。
β受体阻滞剂、非二氢吡啶类钙通道阻滞剂可降低心肌收缩力、减轻左心室流出道梗阻、改善左心室壁顺应性及左心室充盈，也具有抗心律失常作用。
应注意观察血压，防止血压过低；压力阶差＞60mmHg，药物治疗无效，可进行手术治疗，可行肥厚肌肉切除术。
合并严重二尖瓣关闭不全的患者，可做二尖瓣置换术；有介入微创适应症的，可以采用介入微创如酒精消融手术治疗；不能耐受外科手术或效果差者，可以采用心尖起搏进行治疗。