先天性的房间隔缺损，也就是原发孔型房间隔缺损，是不能够自愈的。因为先天性的房缺，大多伴有二尖瓣或者三尖瓣畸形，是不可能自行长好并闭合，一般需要尽早手术治疗，避免时间长了出现心衰等并发症，影响患者寿命。
继发性的房间隔缺损，有一部分是能够自愈的，也就是有一部分房间隔缺损的患者会逐渐闭合，但是概率比较低，就算不能完全闭合，只要房间隔缺损的很小，也基本上不用处理，可以当做正常看待。但要根据医生的要求，定期做心脏彩超复查，避免病情出现加重。