锁骨囊肿绝大多数情况下，没有任何的临床症状。只有一小部分会出现锁骨的疼痛，而且这种疼痛的个体差异性比较大。有些患者表现为隐隐的作痛，而有一部分患者则表现为剧烈的疼痛，剧烈疼痛的情况还是占极少数的。
在临床上，锁骨囊肿发生的几率比较低，因为这种疾病大多数没有临床症状，没有症状患者不会就诊，也谈不起发现。
除此以外，这种疾病的发现，往往是由于患者在做常规的筛查，或者是肩关节有外伤做常规检查的时候才发现有囊肿。另外，极少数的情况下，是由于囊肿产生病理性的骨折，患者前来就诊的时候才发现之前有囊肿。
针对该类疾病是否需要治疗，要结合患者有没有临床症状以及锁骨囊肿的大小决定。因为锁骨本身比较细，一旦产生比较大的囊肿，有可能会导致病理性的骨折。
所以，如果患者有明显的临床症状，锁骨囊肿又比较大，需要进行治疗，否则可以不处理。