小儿隐睾手术时间，需要根据隐睾的位置来决定。低位隐睾手术时间相对较短，大约于60-90分钟左右即可完成。高位隐睾则需要适当延长手术时间。有时睾丸位于腹腔或者腹膜后，则需要延长切口进行探查。手术时间可延长至120分钟-180分钟左右。
术前通常会行B超、CT来明确睾丸的位置，大致就可以预估手术时间。如B超发现睾丸就在腹股沟内或者皮下环内等，则手术通常于60分钟左右即可完成。位置越高，手术时间越长，尤其是腹腔内的睾丸、腹膜后的睾丸，则手术适当需要延长时间。
隐睾患儿有时也合并有先天性斜疝，如术中发现有先天性斜疝，通常会同期做疝囊高位结扎，对于合并有先天性斜疝的患儿则手术要适当延长30分钟左右，来进行疝囊高位结扎的手术。