乳腺囊性增生病需要与以下疾病相鉴别：
1、乳腺癌：无痛，肿块常单发、不光滑、质硬、活动度差，常有腋窝淋巴结转移性肿大。与月经周期无明显相关性，乳头溢液细胞学检查可见异形细胞。
2、乳房纤维瘤：好发于20-25青年女性，多发生于外上象限，多单发、边界清楚、增大缓慢，质硬似橡皮球或乒乓球的弹性感，表面光滑，易于推动，与月经周期无关。 通过乳腺核磁等可鉴别判断。
3、乳痛症：是乳腺结构不良症的早期病变，主要表现为乳房胀痛、乳房肿块等，并有明显的周期性和自限性特点。病理结果提示为实性肿块时可鉴别诊断。