卡斯钦-贝克病的病因尚不明确，通过改善水质、调整饮食结构、补充无机盐等可降低其发病率，对与疾病高发地区人群，需每年进行相应的检查，对于卡斯钦-贝克病有早期筛查作用。
1、改良水质：针对病区居民饮水矿化度较低、自然污染较重的情况，应努力改良水质。有条件家庭可依据当地水文地质条件打深井，或引用水质好的泉水。应加强对饮水源的保护，防止污染，也可建设滤水设施。
2、改善粮食质量：针对病区居民食物单调、偏食情况，提倡应农作物种植多样化，在粮食的收割、运输至贮存，都要及时充分晾晒或烘干，防止粮食霉变，谷物磨粉前后也应保养充分干燥，以遏制霉菌的繁殖和产生毒素。
3、补硒：可考虑农作物喷硒，例如农民可在小麦或玉米的扬花期前后，向叶面喷洒亚硒酸钠水溶液，还可给盆硒土壤施氮、磷、硒复合肥料，也可在食盐中加硒。