肾结石的发病原因目前还不是非常清楚，存在几种假说。但许多因素的存在则会促进肾结石的形成，比如说性别及遗传因素：男＞女，白种人发病高于其他人种；饮食结构变化：动物蛋白及精致糖摄入增多，纤维素摄入少；高温环境及活动减少；尿液因素：尿酸性减低，PH值增高及尿量减少；泌尿系解剖结构异常：肾囊肿等；都可以影响肾结石的形成，肾结石的成分主要是尿液中多种溶解度很低的有机物和无机物。如果按照结石成分所占比例的高低顺序来划分，则依次是草酸钙，磷酸钙，磷酸铵镁，尿酸，胱氨酸及黄嘌呤结石。