通常对舌咽神经痛诊断非常有效的辅助检查措施，就是做局部的黏膜麻醉试验，让患者口张开发“a”的音，然后注射器抽取利多卡因或者是丁卡因等黏膜麻醉药物向一侧咽后壁扁桃体区域喷洒。如果患者疼痛症状立刻消失或者明显缓解，通常能够诊断为舌咽神经痛。此外，还需要做头部的核磁共振或者颅脑CT，检查桥小脑角区、颈静脉孔区有无肿瘤等因素的存在导致的继发性舌咽神经痛。