怀孕五周如果做药物流产是可以的，因为做阴道彩超的时候应该看到孕囊，看到孕囊可以做药物流产。但是做人工流产不可以，由于孕囊太小，做人工流产有可能会出现漏吸，也就是没有将孕囊流出来，有可能怀孕还在继续。做人工流产最好是在怀孕的40-60天之间，这个时间做人工流产对病人的身体损伤最轻，出血也比较少，手术时间也比较短，不全流产的发病率也最低。药物流产有可能会出现不全流产，不全流产的发病率能够达到10%，如果是药物流产出现不全流产需要再次刮宫，对子宫的伤害比较严重。