低位复杂肛瘘应该住院手术治疗。肛瘘是非常常见的肛门病，由肛腺感染引起，大部分都是由肛周脓肿破溃后发展而来。肛瘘这个疾病一旦确诊，必须手术治疗。肛瘘大致可以分为低位肛瘘和高位肛瘘，也可以分为单纯肛瘘和复杂肛瘘。如果是低位单纯肛瘘，手术过程短，术后恢复顺利，术后复发率低。如果是高位复杂肛瘘，手术时间长，术后恢复时间长，复发率也比较高。如果是低位复杂性肛瘘，手术时间和术后复发率情况在二者之间。建议到正规医院的肛肠科就诊，由富有经验的肛肠科医生实施手术，才能把术后复发率降到最低。