对于动脉血栓的治疗，主要是依靠抗凝、抗血小板的药物。注射低分子肝素+华法林，具有抗凝作用，主要用于防治血栓栓塞性疾病。新型口服抗凝药物利伐沙班，是目前适应证较广的一种新型抗凝药，具有起效快、不需要常规的调整剂量、较少的食物药物相互作用、无需常规监测血凝等优点。达比加群也是新型口服抗凝药，而且还有拮抗剂，抗凝过度时可以拮抗治疗。上述药物对肺动脉血栓疗效较好。对其他脏器的动脉血栓，可以应用抗血小板聚集药物，比如阿司匹林、氯吡格雷、替格瑞洛、双密达莫等。无论哪个部位的动脉血栓，都可采用介入手术进行血栓抽吸和血管重建治疗。