一般认为，肛瘘和肛周脓肿是一个疾病发展的两个阶段，肛瘘是肛周脓肿的后期，是炎症的慢性化阶段。它的来源主要是肛腺感染和皮肤感染两个途径，其中以肛腺感染最为常见。肛瘘的表现主要有反复的破溃、流脓、溢液，有时可伴有粪便或者鲜血自瘘口流出。如果伴有感染，可再次出现肛周脓肿的表现。