颌骨囊肿本身就有一定复发几率，尤其是有的病理特点本身就容易复发，例如颌骨角化囊肿。角化囊肿经常不只是复发，有可能是多发的状态，有可能一个患者在同一时期内整个颌骨内有3-4个角化囊肿的出现，所以即使做了手术，也有可能出现颌骨囊肿迅速复发。另外针对角化囊肿同样会在其周围形成一定的卫星灶，类似于卫星囊肿，这种囊肿在手术时非常难以察觉，所以在术后特别容易在其周围再次形成囊肿。因此针对颌骨囊肿，除较为简单的含牙囊肿，大部分囊肿都有复发的几率。