病毒性脑炎恢复了3年，一般不会再复发。病毒性脑炎按疗程治疗后，如果病人的头痛、发烧等症状消失，脑电图结果表现也正常，化验脑脊液的各项指标均无异常，可以认为疾病治愈，一般不会复发。
如果再次感染了病毒，并且病菌的毒力较强，而人体的抵抗力较弱的时候，可能会再次患有脑炎。但这种情况属于新发，不属于复发。一般容易反复出现脑炎的人，多见于免疫功能缺陷者如艾滋病患者或者长期服用免疫抑制剂的患者如结缔组织病、脏器移植后患者