婴儿先天性心脏病的临床症状，跟先天性心脏病的类型和严重程度有很大关系。比较轻型的先天性心脏病，比如房间隔缺损、室间隔缺损和动脉导管未闭的婴儿，早期的时候常没有症状。随着月龄增加，缺损和动脉导管可以闭合，跟正常的孩子一样，只是在体检的时候会听到心脏的杂音。
病情比较重的先天性心脏病，往往会出现生长发育落后、消瘦、体重增长不良、吸吮无力、喂养困难，或者婴儿表现为拒食、吃奶呛咳、呼吸急促、哭闹，甚至有口唇和指甲的青紫、孩子不爱活动、运动以后多汗、面色苍白等等。去医院体检的时候，医生往往会听到明显的心脏杂音，并且心脏会出现扩大。