布加综合征的鉴别诊断主要是症状鉴别，因为布加综合征会出现肝脾的肿大，所以临床上首先要和，比如肝脏、胃、脾功能亢进、脾肿大进行鉴别，同时它还会出现大量的腹水，要和腹水的鉴别，同时它会出现下肢的肿胀，甚至下肢的血栓形成，所以还要和下肢静脉血栓形成相鉴别，同时还会伴有下肢静脉曲张，所以还要与下肢静脉功能不全相鉴别，有些病人还会出现下肢的溃疡、皮肤颜色的改变，还要与下肢的其他皮肤病、皮炎相鉴别。