在贲门癌的早期阶段病人可以没有明显的临床症状和体征，即使伴有了一些症状，也是非特异性的消化道症状，比如一部分贲门癌的病人可以出现上腹部不适，或者上腹部隐痛的症状，这种症状常在进食之后明显加重。
如果贲门癌病情发展，累及到食管下端，病人就可以出现吞咽困难，而随着癌肿的增大，吞咽困难的症状也可以进行性加重，甚至可以导致连流质的食物也难以咽下。一部分贲门癌发展到晚期可以发生腹膜转移，从而导致恶性腹水的出现，这个时候的病人会合并有明显的腹胀症状。