脑型疟疾是严重的中枢神经系统感染性疾病，一旦确诊后立即开始抗疟疾治疗。常用的药物治疗和普通疟疾一样，都是使用氯喹、阿莫地喹、哌喹、奎宁等药物，具体的剂量根据患者体重以及基础疾病、年龄等来决定。同时要注意患者如果有明显发热，要卧床休息，如果有明显头痛，必要时使用甘露醇或者甘油果糖脱水，减轻脑水肿，降低颅内压力。注意监测血糖，如果发现低血糖必须及时纠正，防止引起低血糖脑病、低血糖昏迷。如果有缺氧、低氧血症要及时给予吸氧，注意水分的补给，发热会大量失水，脱水也会导致液体流失。如果患者食欲不佳，要给予流质或半流质饮食，并且加强静脉补液。如果患者有寒战要注意保暖，更换湿掉的衣物，高热时可以物理降温，比如使用冰帽、冰毯，做好脑保护处理。