会厌囊肿和会厌癌鉴别，这是完全不同性质的两种疾病。
会厌囊肿可以是先天性的或者后天性腺体口堵塞导致的，会厌癌是一个恶性肿瘤。从症状来看，很大的会厌囊肿可能会有咽部异物感或者咽喉堵的症状影响吞咽。
会厌癌的症状在早期可能也会有咽部异物感、痰里带血的症状，疾病发展可能会造成喉咙疼痛或者痰中带血加重、颈部淋巴结转移的症状。
从喉部检查来看会厌囊肿可能会长在会厌谷、会厌的边缘等部位，是一个光滑囊肿样东西。会厌癌可以长在会厌的喉面、舌面，是一个新生物，表面不光滑，可能会有破溃、伪膜等表现。