大三阳的患者如果肝功能正常，一般不需要服用任何药物治疗。但如果大三阳的患者有合并肝功能的损害，出现转氨酶的持续升高，且无法自行缓解，这个时候就要考虑服用保肝药物进行治疗。
如果检查乙肝DNA也呈阳性，并且转氨酶持续升高，且排除其他原因所导致，这种情况需要考虑抗病毒治疗，抗病毒药物包含恩替卡韦、替诺福韦、拉米夫定等等。
抗病毒药物需要长期服药，至少要3-5年，有的甚至要服用终生。抗病毒药不可以随意停药，因为随意停药很容易导致病毒出现反跳，如果需要停药，需要在医师的意见下逐步停用。
此外，如果大三阳的患者乙肝DNA呈阳性，但转氨酶是正常的，如果肝脏出现肝纤维化、肝硬化或者合并肝癌，以及有肝癌的家族史，也同样需要服用抗病毒药物治疗。