血清阴性脊柱关节病常见病因有以下几种：第一、先天性遗传因素，有家族史的患者发病率为正常人群的20倍以上，88%以上的患者血清组织相容性抗原HLA-B27阳性，而其一级亲属HLA-B27阳性率为50%以上，因此遗传因素是血清阴性脊柱关节病重要病因。第二、感染以及自身免疫功能障碍、环境因素，均是血清阴性脊柱关节病的重要病因，以上因素可以造成HLA-B27阴性患者发生血强直性脊柱炎，通常与免疫功能发生紊乱有关。