首先是每日饮水2000-3000mL，昼夜均匀，其次可以配合应用止疼药物，例如双氯芬酸钠。可以减轻输尿管的水肿，减少疼痛发作，促进结石排出。口服α受体阻滞剂例如坦索罗辛，可以起到使输尿管下段平滑肌松弛的作用，促进结石的排出。
有一部分中医中药，例如尿石通、排石颗粒等，有清热利湿、通淋排石的作用，佐以理气活血、软坚散结。有一些特殊成分的结石可以用溶石疗法，例如尿酸结石和胱氨酸结石、尿酸结石可以口服别嘌呤醇、枸橼酸氢钾钠、碳酸氢钠等等，以碱化尿液；胱氨酸结石可以口服枸橼酸氢钾钠，或者碳酸氢钠以碱化尿液。要注意毒副作用还要配合适度的运动，通过这些方法综合治疗，才可能有利于肾结石排出。