补牙是否会酸与具体情况有关，龋坏发生在釉质层时分布的神经纤维较少，切割牙体组织和修补窝洞不会产生酸疼。龋损位于牙本质层，并接近牙髓时，磨除腐坏牙体组织能使牙本质小管末端开放，外界刺激会使其产生酸痛。
如果不使用氢氧化钙进行垫底或护髓，补牙材料释放的化学物质会激惹牙髓，产生酸胀。涂布酸蚀剂时滞留的药物有可能进入牙体内部，从而产生持续的酸痛，1-2周后症状才能缓解。