霉菌性阴道炎的治疗，不论是中医还是西医都无法做到根治，与女性的解剖结构有关，女性的外阴、阴道、宫颈、宫腔、输卵管与腹腔相通，整体处于一个管道系统。霉菌性阴道炎实际是感染性疾病，感染的来源主要是外界微生物的侵入，可以通过性生活、手术操作，还有口服抗生素等方式侵入，其感染的原因还是由于体内的免疫功能机制下降，从中医的角度是由于五脏六腑功能失调，导致霉菌性阴道炎。在治疗的时候，一方面要针对病原体进行治疗，另一方面还要提升患者的免疫功能，治疗之后要防止复发，这是非常大的工程，需要提升免疫功能，还要要注意个人卫生、性生活卫生，避免接触性感染，同时，还要加强身体锻炼、加强营养，提升免疫功能。
所以，霉菌性阴道炎可以治疗，但是不可能完全根治。很多患者希望有能够根治的方法，但是由于不能够限制性生活，也不能限制不来月经，所以不可能完全做到根治，只能做到阶段性的治疗。