对于脱发性毛囊炎，应消除诱因，根据患者具体情况选择局部外用抗生素、皮质类固醇等外用药物，如皮疹广泛，需要全身使用抗生素，对于极其严重的病人，可以抗生素及皮质类固醇联合应用。
一、一般治疗
1、去除诱因，避免皮脂分泌旺盛，积极治疗贫血、血糖异常等疾病。
2、注意皮肤的清洁卫生。
二、药物治疗
1、抗生素：选择对需氧革兰阳性菌有强抗菌作用，尤其是对金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌以及其他与皮肤感染有关的病原菌抗菌活性强的药物。
（1）莫匹罗星乳膏：外用抗生素药物，相对安全，对其成分过敏者禁用。
（2）夫西地酸乳膏：一般无副反应，偶有刺激性，罕见过敏反应。
2、皮质类固醇：具有抗炎、免疫抑制以及抗增生的作用，如丙酸氯倍他索乳膏，每天使用不要超过两次，不建议长期使用，必须在医生指导下使用。
3、葡萄球菌菌苗：采用皮下注射葡萄球菌菌苗的方式，可以增加机体对患病菌群的免疫力。通常可将患处分泌的脓液进行培养，制得患者自身的菌苗进行注射，效果较好。
三、手术治疗
此病一般不进行手术治疗，若出现皮肤脓疱，可以行手术切开将脓液引流。
四、物理治疗
针对脱发性毛囊炎还可采用激光疗法，在低功率激光疗法中，通过使用低能量激光照射毛囊，使毛囊炎性反应得以减轻，同时促进细胞新陈代谢，从而使休止期毛囊复苏，达到促进毛发生长的作用。