着色芽生菌病损害好发于身体暴露部位，最常见于小腿、足部和前臂。大致表现为结节性梅毒疹样、银屑病样、疣状皮肤结核样、乳头瘤样和瘢痕象皮肿样，长期增殖性病变有可能癌变。病程较长时，可并发肢体损害，出现象皮肿及畸形。
1、结节、斑块：开始为粉红色小丘疹逐渐扩大成突出的结节，融合成斑块，高出皮肤之上。
2、通过表皮排除现象：表面疣状或乳头瘤样增生，呈污秽状，常有溃疡并结褐色的痂，压之有少量脓液溢出，皮损表面常有黑点，为重要的病理现象，称“通过表皮排除现象”。黑色的病原菌被排除到表皮形成黑点，故在此处查菌容易阳性。
3、瘢痕：皮损边缘清楚，周围皮肤呈暗红色或紫色浸润。老的损害可自愈，留下萎缩性或肥厚性瘢痕。损害可沿淋巴管扩散，在四周形成新的结节，有时呈带状分布，如孢子丝菌病样，亦可经自我接种或损害直接蔓延而扩大。