结肠癌与遗传有一定的相关性，并且相对其他肿瘤来说，遗传倾向比较明显，有20%-30%的患者与遗传相关。主要分为两种情况，一种是遗传易感性，另一种是遗传性大肠肿瘤。前者指的是有大肠癌的家族史，后者主要包括两大类的遗传性大肠肿瘤，即家族性的腺瘤病和遗传性非腺瘤病性结直肠癌。有10%-15%的大肠癌发生于一级亲属中，包括父母、兄弟、姐妹和子女患大肠癌。有文献报道，对于有大肠癌家族史的人，做结肠镜检查，腺瘤的检出率为21%-40%，至少约80%的大肠癌是腺瘤演变而来，所以可以检出腺瘤，并且予以摘除，来预防大肠癌的发生。
目前已经有两种遗传性的易患大肠癌的综合征被确定。一种就是家族性腺瘤息肉病，占大肠癌患者的0.5%-1%，分子基因学已经证实遗传性大肠癌的发生与基因变化的相关，这种疾病是APC基因突变导致一系列基因变化的结果。另一种是遗传性非息肉病性大肠癌，大肠癌中5%-10%发生于本病，主要是因为错配修复基因突变导致的恶性肿瘤。