扁平疣属于HPV的病毒感染，病毒可以表现在感染皮肤、黏膜的位置。理论上皮肤表面的任何位置都可以长扁平疣，故扁平疣可以长在肛门处或肛周，相对来讲扁平疣更好发在四肢、躯干等部位。
如果长在肛周附近的扁平疣同时表现为菜花状或者乳头瘤状，有可能是尖锐湿疣，而不是扁平疣。两者的病毒种类不一样，治疗手段有少许差别，但治疗难度有比较大的差别。所以，如果出现长在肛门处的扁平疣，应尽早到医院皮肤科进行就诊，在确定诊断以后再进行治疗。