三叉神经痛病因到现在还没有完全清楚，临床上主要的学说是三叉神经血管压迫学说。它认为三叉神经发生的原因主要是颅内的血管压迫三叉神经，尤其压迫三叉神经的根部，导致三叉神经脱水鞘病变，因为所有的神经活动都是电生理活动，神经相当于脑袋里面的电线。神经的脱水鞘病变，相当于电线外面的绝缘层消失，裸露在外面造成短路，短路造成神经信号的放大。信号被放大以后，正常的触摸、洗脸、进食、讲话、甚至吹风刺激信号被放大，放大到一定程度，达到痛阈，就会引起相应区域的剧烈疼痛。这就是血管压迫学说的主要依据。