牙髓炎根管治疗的后遗症比较多。第一、器械分离，根管治疗器械操作不当，当所加的外力超过金属器械本身的抗疲劳限度，器械很容易发生分离。第二、穿孔，根管治疗引起的穿孔，因牙本质过度切削，引起牙髓腔和牙周组织相通，对牙周组织可产生机械性和化学性损伤并感染，容易引起急性炎症。根管的过度预备也会引起根管的刺穿。第三、软组织的化学损伤，根管的清洗剂以及消毒药物，引起软组织的化学损伤。第四、急性根尖周炎，就是我们所说的诊间急症，在根管预备或者充填后，少数患者会出现局部的肿胀、咬合痛、自发痛等症状。临床上一般由多种因素共同刺激根尖周组织产生诊间急症，如细菌的刺激、化学药物的刺激、牙髓失活剂的刺激以及根管消毒药物的刺激。其它的还有一些不常见的后遗症，比如器械的误吞、误吸、皮下水肿、残髓炎等等。