甲氨蝶呤可以治疗强直性脊柱炎，强直性脊柱炎是一种自身免疫性疾病，主要引起骶髂关节及脊柱等慢性无菌性炎症，出现腰骶疼痛、活动受限、僵硬。
甲氨蝶呤是一种治疗慢性疾病的药物，主要适用于柳氮磺胺吡啶或非甾体类抗炎药治疗无效时，它具有降低红细胞沉降率、C-反应蛋白等改善局部症状的作用，使患者得到较好的恢复。强直性脊柱炎无特效疗法，应该积极的功能锻炼才可以得到更好的恢复。