颈部手术所致副神经损伤主要治疗方法为手术治疗，并使用药物治疗、物理治疗等辅助治疗。颅底骨折所致副神经损伤的治疗，大都采用神经营养药物及血管扩张剂为主的保守治疗，配合理疗、针灸治疗。颅底肿瘤枕骨大孔区畸形等所引起的副神经损伤，应先行原发病变的手术，去除原发病是保证副神经功能恢复的基础。
一、药物治疗
1、神经营养药物：可改善神经细胞代谢或改善微循环，促进神经生长及恢复。如维生素B1、维生素B12、神经生长因子、腺苷钴胺等
2、血管扩张药物：可用于扩张血管，改善微循环，有助于神经细胞的生长。如尼膜同，低分子右旋糖酐等。
二、手术治疗
1、副神经松解术：如副神经未断裂，电刺激检查仍有传导功能，应作神经松解术。神经松解必须彻底，去除粘连，切除瘢痕组织，注意勿损伤神经纤维，同时在神经周围注射醋酸氢化可的松5ml。术中止血应彻底，放橡皮引流条24～48h，不需外固定。
2、神经吻合术：如副神经已断裂或一小段神经完全瘢痕化，则可游离其远近端，采用抬肩、头颈屈向患侧姿势，以利克服缺损进行神经吻合术，术后用石膏固定于上述姿势4周。
3、神经移植术：如副神经断裂，局部缺损较多，行断端吻合困难，则应行神经移植术。一般取附近耳大神经移植。其余处理同神经吻合术。
4、肌腱转移术：如伤后时间过长，神经吻合或移植效果多不理想，可作肌腱转移术，将提肩胛肌转移代替斜方肌功能。具体方法是将提肩胛肌转移至肩胛嵴近肩峰约3.8cm处，并取阔筋膜条固定肩胛骨内缘(肩胛嵴下3.8cm处)于第2胸椎棘突上，术后人字形石膏固定患肢于后伸、中度外展位4周。
三、物理治疗
通过应用红外线、超声波、低中频电疗、热疗等体外的物理治疗，对因副神经受损导致局部肌肉的麻痹，有较好的疗效，原理是通过促进血液循环，给肌肉一定的机电刺激，改善瘢痕组织对神经的粘连和压迫，促进神经的再生。同时还具有消除炎症、促进水肿吸收的效果。
四、中医治疗
对于中医治疗来说，副神经损伤病因是外伤导致的副神经节段受损，并且由于神经损伤，局部肌肉僵硬、麻痹、活动受限。这时可给予舒筋活络、活血化淤的方药进行调理，同时配合针灸推拿治疗，松解组织黏连，缓解患者的局部症状。
五、其他治疗
康复训练：运动作为一种生理刺激，能改善局部血液循环，训练肌肉有节律的收缩运动。因此在医院治疗期间，也可以选择前往康复科。在康复科医师的指导下，通过一些器械辅助，进行康复训练，达到延缓肌肉萎缩，利于支配肌肉的神经再生的目的。