肛周湿疹的治疗可以通过一些外用药物处理，比如氟轻松软膏或者皮炎平软膏，最好将肛周局部皮肤清洗干净之后再涂抹上述药膏，效果可能更好，或者使用高锰酸钾稀释液、中药熏洗、坐浴后涂抹药膏，效果更好。
临床一定要找到引发肛周湿疹的原因，及时避免复发。如果是内衣的材质不好，要及时更换棉质的内衣，防止过敏产生的湿疹。如果是本身免疫力低下导致的肛周湿疹，建议加强锻炼。如果是一些性传播疾病导致的肛周湿疹，建议积极抗病毒对症、支持治疗，在治疗期间要避免性生活。