对于孤独症的儿童，通常治疗方面主要是采取心理治疗及行为治疗，辅助性的应用药物治疗。单靠药物不能够根本扭转或者改变孤独症的核心问题，尤其某些核心突出的症状，如刻板地重复、攻击、自伤，甚至破坏。出现类似于行为的时，采用合理的药物能够起到一些辅助的作用。通常可选择一些代表药物包括利培酮，抗抑郁方面可以用氟西汀、舍曲林，治疗注意缺陷方面可以用哌甲酯、托莫西汀等。但是更应该重视孩子的心理治疗以及后天的行为功能锻炼。