先天性冠状动脉疾病，主要是冠状动脉解剖结构异常，也就是从先天发育中出现的解剖结构的异常，中间有走行的异常，在走行异常当中主要是由于左冠状动脉或右冠状动脉起源异常。而使得冠状动脉走行于主动脉和肺动脉之间。
当剧烈运动之后主动脉扩张，而压迫冠状动脉，可以造成冠状动脉的受压，引起缺血、晕厥，甚至猝死，这是最为严重的后果。如果在青少年运动当中出现猝死，需要警惕这种疾病的情况，一旦发现应该手术治疗。
除此之外，其他的冠状动脉走行异常，比如冠状动脉、肺动脉瘘，或者是冠状动脉的壁冠状动脉也叫心肌桥，通常到成人之后才发现，一般没有大的危害。