手术治疗先天性巨结肠需要多少费用，一般要依据患者手术方式不同，手术后患者是否出现腹腔出血、感染等并发症的因素来进行分析。
一、如果患者自身的愈合能力欠佳，此时采用传统的开放手术，切除先天性巨结肠。由于开放手术创伤较大，术后患者恢复缓慢，容易造成腹腔出血、感染、切口脂肪液化等并发症，手术后需要较长时间的抗感染，切口换药处理，患者住院时间明显较长，费用大约需要5万元左右。
二、如果患者采用腹腔镜下微创手术治疗先天性巨结肠术，手术的创伤相对较小，患者术后恢复较快，且术后没有发生严重并发症，此时可以明显缩短患者的住院时间，治疗费用明显降低，一般需要2-3万元左右。