甲状舌管囊肿的患者一般没有自觉症状，多见于1-10岁的儿童，有一些也见于成年人。它生长比较缓慢，质地比较软，发生在颈中线，有时候会往左或者往右稍微偏斜，高度在舌骨的上下附近。它有一个特征性的依据，经常可以随着吞咽、伸舌的运动而上下移动。
很多患者发现自己得了甲状舌管囊肿，都是通过别人、亲戚朋友发现的。但是甲状舌管囊肿有时候会有感染，如果感染了，它的体积会突然的变大，有的会形成瘘管，穿刺不是透明的而是微微浑浊、黄色、稀薄的黏稠液体。
甲状舌管囊肿切除一定要非常彻底，由于绝大部分都会和舌骨粘连，或者直接穿过舌骨中份，需要把舌骨中份一块切掉，不然非常容易复发。甲状舌管囊肿如果长期不治，还有发生癌变的可能。