扁桃体炎的治疗可以分为急性扁桃体炎和慢性扁桃体。急性扁桃体炎主要是由于感染引起的，包括细胞病毒感染或病毒感染过后的继发细菌感染。抗感染治疗，比如头孢抗生素，还有清热解毒的中成药，比如一清胶囊、蓝芩口服液等。有发热、查血常规、血象较高的患者可以输液治疗，在输液的时候，可以同时用糖皮质激素输液治疗，这是急性扁桃体炎。慢性扁桃体炎反复发作，或慢性扁桃体炎继发其他脏器的疾病，比如肾炎、风湿性关节炎等。要考虑进行手术治疗，摘除扁桃体，扁桃体成为了肾炎或关节炎的病灶，慢性的病灶型的扁桃体炎。