卵圆孔未闭是一种先天性的心脏结构异常，是指胚胎时期就存在的心脏血管结构。婴儿出生以后应当闭而未闭合形成的畸形，实际上是发育的异常。卵圆孔一般形成在胚胎发育的第6-7周，卵圆孔的胎儿时期左右心房之间是一个血液的通道，来自母亲的脐静脉血通过此通道从右房进入左心房，进而进入胎儿的左心腔，然后流向全身为胎儿提供营养。
在胚胎的发育过程中心房之间先后形成了两个间隔，先发生的间隔为原隔称第一隔，后出现的隔为继发隔称第二隔，两个间隔之间逐渐融合形成两个心房。继发隔不继续生长中途停止，与原发隔之间未能融合留下一个小的裂隙，就称为卵圆孔。新生儿出生之后随着孩子的第一声啼哭，左心房的压力升高，使左侧的原发孔紧贴在右侧的继发隔上，左心房的血液断绝形成功能性的关闭，之后逐渐形成永久性的闭合。大多数的卵圆孔孩子在生后两个月左右就关闭了，一年内可以彻底关闭也就是长在一起。