肛周脓肿做手术是没有害处的，因为肛周脓肿一旦形成之后，在肛门周围局部就形成了脓疱。这个脓疱如果不进行手术，可以选择保守治疗，也就是吃药，但是保守治疗的效果是非常差的。
因为肛周的脓肿，局部的细菌比较多，在肛门的附近，由于大便的污染，会导致脓肿进一步的加重，脓肿加重之后，自我恢复很难的。所以最好还是做手术。手术的治疗原则和目的，就是将脓肿进行切除，预防脓肿进一步的发展。
脓肿进一步发展会形成肛瘘，肛瘘一旦形成就不可收拾，是非常厉害的。所以及早的做手术是没有害处的，但是手术一定要做得彻底与根治，如果手术做得不彻底，术后还是容易复发的，肛周脓肿一定要引起来重视。