睾丸及睾丸附件的解剖结构异常，是导致睾丸扭转的主要原因，其中包括睾丸鞘膜腔宽大、系带过长、引带发育异常、鞘膜过度包绕睾丸，以及附件连接松散等等。另外，既往有睾丸肿瘤、精液囊肿、睾丸外伤、腹股沟手术史，可以增加睾丸扭转的风险。男性夜间迷走神经兴奋，导致提睾肌收缩增加，也可能导致夜间睾丸扭转的几率明显增加。除此之外，睾丸扭转也常常在寒冷季节发生，在温暖的地区或者夏天发生常常较少。